同时，南甸宣抚司的级别还比较高，拥有的人口也较多，可以说实力雄厚，而且辖地广阔，在滇西十土司中占有十分重要的地位。
因此南甸宣抚司使龚绶以“十司领袖“自居，其实力和影响在滇西土司区是首屈一指的，统治尤为牢固，其制度在民国以前也较为完整。
在民国之初，改土归流之议日高，有识之士纷纷进言献策，推行改土归流。
不过当时云南地方政府认为，“在此国防建设薄弱时期，土司既为一般边民所信服，尚须赖其号召团结，共御外辱，似难遽为废除，转贻鞭长莫及之忧至于设官分治，原与土司制度系属两事。”遂推行了渐进的改流举措。
所以在民国时期，南甸宣抚司改土归流可以大体分为三个阶段。
首先是第一阶段，也就是多方举措，渐进改流。
到了1912年，腾冲县移司狱于南甸辖区，设八撮县丞南甸司地距腾冲较近，时隶属腾冲县。
国民军滇西总司令同时发布《饬腾冲府知府黄永谦永禁南甸土司管理司法令》，“以后凡土司所属人民，种无分汉夷，事无锔细，所有切民刑诉讼案件，自阳历八月初一起，概行归腾冲府管理，该土司不得再行收受呈词，但遇有抢劫重案，该土司仍有协力缉捕之责。”
同月，首任县丞到任，治所小邦杏。
8月，二任县丞曹之骐上任，扩大县丞权力，组织税务，派兵派款。
同年，南甸营城脱离司治，划腾冲城保，改名为九保。
1914年，改八撮县丞为八撮分治员，治所迁到大厂。
分治员在八撮地区倡办新学，读新编教科书。
1916年唐继尧派兵至南甸司地督铲烟苗。
同年，省政府同意石孩坡抚夷脱离南甸司，归属陇川行政委员会。
1917年，改八撮分治员为八撮县丞。
4月，给操纵南甸武装抗铲的土司龚绶以革职留任处分。
1928年，云南省政府改禁种鸦片为征收烟税，向南甸征收烟税。
1930年，裁八撮县丞，改设腾冲第六区公所。
1931年，第一殖边督办署派袁恩膏到大厂恢复县佐，筹建设治局。
袁恩膏成立了民众自卫大队把县佐时所辖八撮扩大到除铜壁关，盏西外的土司全境，设立五区设立民众办事处。
同时联合反土亲流绅士推行改土归流计划支持江东抚夷杨定才，派兵镇压江东亲土司的权绅。
1932年，改县丞为梁河设治局，并改五区为十九乡镇。
同年，省政府将南甸“飞来地“铜壁关，蛮允划归莲山设治局。
1933年，设治局连续两年截收土司三大款共三万余元。
1935年，督办署游击大队长周子才代理局长，征调壮丁成立常备队，加强财政税收工作。
1936年设治局推行新滇币，省教育厅办省立小学，以局署驻地大厂为本校，以司署驻地遮岛为分校。
1937年，土司和设治局组织民工参修滇缅公路龙陵至暮康段。
7月20日，龚绶因反对设治局搞清丈，公买烟，调兵攻打设治局，被解省入狱。
1940年，通过疏通，龚绶才出狱回到司署，经政府批准，子龚统政承袭宣抚司使职。
后来，在滇西抗战爆发前，云南地方政府在对南甸宣抚司予以安抚的同时，通过设置的一系列管理机构推行了清查户口，清丈土地，征收赋税，兴办教育，禁绝烟毒等政令，以期削弱土司权限，加强政府统治，以便最终完全废除土司。
虽然此时流官体制没能完全取代土司制度，但土司的权力已有一定削弱。
至于第二阶段的话，因为团结土司，改流停滞。
19