造起来的移动迷宫，最后都被证明，根本没用。这种莫名其妙的试炼，对制造出解药根本就没有什么影响。
而真正能够对抗闪焰病毒的解药，根本就是男主角托马斯的血液。这个结果，也真是够讽刺的。
在剧情中，男女主角托马斯和特蕾莎不但是免疫者，更是ckd的一员，因为托马斯不愿意再看到其他那些免疫者在迷宫中受折磨，而主动进入迷宫中，成为迷宫中免疫者的一员。
这些人花费了多年探索迷宫都没能走出迷宫，结果在男女主角先后到来之后，没用多久托马斯便带着少数愿意信任他的人逃出迷宫。
然而，走出迷宫，也只是另一个试炼的开始。
在迷宫外的研部门中，ckd的主要负责人爱娃·佩吉假并告诉托纳斯等人外界的真相，并且告诉他们，他们的试炼才刚刚开始。
随后托马斯等人被一队武装人员带走，而他们也就是爱娃·佩吉录制的视频中杀死ckd研人员的那些人。托马斯他们被带到一座基地中，并被允诺将会把他们送到真正安全的地方。
结果，这座基地根本就是ckd的一部分，而基地的负责人詹森就是ckd安保部分的负责人，所谓的拯救他们，其实也只是对他们进行试炼的一部分。
在现了ckd的骗局后托马斯带着自己的小伙伴们继续逃亡，并最终找到了一个一直对抗ckd的组织“右支”。可惜遭受女主角特蕾莎背叛，ckd找到了右支，不但给予右支重创，更抓走了托马斯的一些朋友。
然后，当然就是救人了。
费时费力抢劫ckd的火车，还真的被他们抢走一节车厢，随后却现他们的朋友没在那节车厢里面，救错人了。
于是托马斯和他们小伙伴们又跑到被称为“最后之都”的城市大闹一场，这群人也确实挺能折腾的，最后之都被他们折腾没了，ckd完蛋了，很多人在营救过程中死了。就连女主角特蕾莎，在先是坑了托马斯，后来又坑了ckd之后也终于功成身退，在火焰之中去领盒饭了。
不过至少他们要救的人真的被救走了，然后带领剩下的人，从此过上了幸福愉快的生活，真是可喜可贺，可喜可贺。